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绪论1

一、群体遗传学概念1

二、群体遗传学发展简史2

三、植物群体遗传学研究的内容5

四、植物群体遗传学研究模型6

第一章　分子生物学与生物统计学基础9

第一节　基因及其有关概念9

一、DNA与染色体9

二、基因与基因表达11

三、遗传密码14

第二节　生物统计基础15

一、概率基本概念15

二、随机变量分布16

三、随机变量的数字特征18

四、抽样分布19

五、显著性检验及参数估计21

第二章　植物群体遗传变异24

第一节　植物群体变异来源24

一、环境条件24

二、基因重组25

三、突变26

四、表观遗传修饰27

第二节　遗传变异基本规律28

一、遗传学基本术语28

二、遗传变异基本规律29

第三节　植物群体遗传变异检测32

一、基于表型的遗传标记检测技术33

二、分子标记检测技术36

第三章 理想群体与Hardy-Weinberg法则46

第一节 Hardy-Weinberg法则46

一、理想群体46

二、等位基因频率与基因型频率46

三、Hardy-Weinberg法则48

四、理想二倍体群体平衡的性质50

五、Hardy-Weinberg法则应用51

第二节 Hardy-Weinberg法则推广52

一、复等位基因52

二、性连锁基因53

三、多基因座56

第三节　同源多倍体60

一、同源四倍体的等位基因分离60

二、理想同源四倍体植物群体平衡62

第四章　植物非随机交配系统66

第一节　植物交配系统66

一、植物繁殖与性别系统66

二、避免自交机制67

三、自交率68

第二节　近亲交配系统69

一、近交程度的度量70

二、自交73

三、近交75

四、混合交配77

第三节　遗传异型与同型交配系统78

一、配子体自交不亲和78

二、孢子体自交不亲和79

三、显性同型交配受阻80

第四节　表型同型与表型异型交配系统82

一、表型同型交配82

二、表型异型交配83

第五章　自然选择87

第一节　选择的遗传学基础87

一、选择类型88

二、适应度和选择系数89

三、选择效应一般遗传模型90

第二节　定向性选择92

一、隐性纯合体净化选择92

二、显性个体净化选择94

三、显性不完全选择96

四、加性基因选择97

第三节　平衡选择98

一、超显性选择98

二、依频选择100

三、减数分裂驱动102

四、依密选择103

五、环境异质性选择104

第四节　其他类型选择106

一、杂合体净化选择106

二、性别差异选择107

三、配子选择108

第六章　遗传漂移109

第一节　遗传漂移的成因及特征109

一、遗传漂移的成因109

二、遗传漂移的特征112

第二节　有效群体大小121

一、雌雄数目不等122

二、群体大小波动123

三、家系大小变异124

四、排除近亲交配126

五、混合交配群体126

六、世代重叠127

七、群体地理散布127

第三节　有限群体中选择128

第七章　基因突变132

第一节　基因突变基础132

一、核苷酸替换132

二、缺失、插入和倒位133

三、转座136

第二节　中性突变137

一、不可逆突变137

二、可逆突变139

三、有限群体中可逆突变141

第三节　非中性突变142

一、完全隐性有害突变142

二、不完全隐性有害突变143

三、加性基因突变144

四、显性有害突变144

五、有限群体中突变与选择联合作用145

第四节 中性突变模型146

一、无限等位基因模型147

二、Ewens抽样方程149

三、无限位点模型152

四、逐步突变模型154

第五节　溯祖理论155

第八章　植物群体阶层结构与迁移160

第一节　植物群体分化与阶层结构160

一、Wahlund效应160

二、群体遗传分化的度量163

三、遗传距离168

第二节　植物群体间迁移171

一、陆岛模型171

二、岛屿模型172

三、距离隔离模型174

第三节　迁移与选择、突变联合作用176

一、迁移与选择176

二、岛屿模型有限群体的迁移179

三、岛屿模型有限群体迁移与突变181

第四节　植物基因流182

一、基因流直接测量183

二、基因流间接测量187

第九章　植物群体遗传多态性189

第一节　遗传多态性产生及维持机制189

一、超显性假说189

二、依频选择190

三、时空异质性191

四、中性突变191

五、减数分裂分离比例偏移192

六、联合超显性192

第二节　植物遗传多态性度量193

一、多态基因座百分比与等位基因数目193

二、基因多样性195

三、核苷酸多态性与核苷酸多样性197

四、Shannon信息指数与多态信息含量198

第三节　遗传负荷200

一、突变负荷202

二、分离负荷203

三、置换负荷205

第十章　植物数量性状遗传207

第一节　数量性状的遗传基础207

一、数量性状的遗传机理207

二、数量性状表型值及其分解208

三、数量性状表型方差及其分解210

四、亲属间遗传相似212

第二节数量性状进化潜力与遗传力215

一、遗传力概念215

二、遗传力估算216

第三节　选择应答218

第四节　数量性状的基因定位222

一、QTL定位原理和步骤222

二、QTL定位基本方法223

第十一章　分子进化与物种形成227

第一节　分子进化227

一、分子序列进化演变227

二、中性理论232

第二节　分子系统发育235

一、基本概念235

二、分子系统发育分析237

第三节　性的起源与进化244

一、性的起源244

二、性的进化245

第四节　物种的形成250

一、物种概念250

二、物种形成的方式251

主要参考文献255